השאלה האם עסק הינו עוסק מורשה או עוסק פטור, רלוונטית לרישום במע"מ. בעת פתיחת עסק חדש, נעשה רישום במע"מ כעוסק מורשה או כעוסק פטור. חשוב להדגיש, כי עוסק פטור פטור מתשלום מע"מ בלבד, ולא פטור מתשלום מס הכנסה וביטוח לאומי.

בעלי המקצועות אשר אינם יכולים להירשם כעוסק פטור, חייבים להירשם כעוסק מורשה.
עם זאת, גם מי שרשאי להירשם שעוסק פטור, יכול להירשם כעוסק מורשה, ומה שעליו לעשות הוא לשנות זאת בתחנת המע"מ שבה הוא נרשם ולהוכיח שמחזור ההכנסה השנתי שלו צפוי לגדול.
עסק מורשה גובה מע"מ עבור העסקאות שהוא מבצע, ומוציא חשבוניות מס בגינן ללקוח. בנוסף, הוא יכול לקזז את המע"מ מרכישות והוצאות שוטפות שמבצע.

היתרון בלהיות עוסק מרשה הוא שניתן לקזז מע"מ מההוצאות השוטפות, אך למרות זאת עוסק פטור חוסך במס יותר מאשר עוסק פטור במצבים בהם ישנו מע"מ שלא ניתן לקיזוז ואז סכום המע"מ מתווסף לסכום ההוצאה, ולאחר הפחתת ההוצאה הכוללת מהרווחים מתקבל רווח נמוך יותר, ולכן משלמים פחות מיסים. עם זאת, עקב אכילס של העסק הפטור היא שתדמיתו נפגעת כיוון שנתפס כעסק קטן.

הנהלים של עוסק מורשה שונים מהנהלים של עוסק פטור, תדירות הדיווח למע"מ שונה, ולכל אחד יתרונות אחרים שמהווים שיקול לצורת הרישום במע"מ הכדאית ביותר עבור כל אחד.